生物物理計算化学者の雛

主に科学に関する諸々を書き留めています。

アメリカには「債務超過の優良企業」があるのかぁ

株式投資に関するブログをいろいろ見て回っていたところ、興味深い記事に遭遇しました。「配当金を雪だるま式に増やす投資日記」 ~Dividend Snowball Investing~: 配当貴族銘柄の紹介 コルゲート・パルモーリブ 鉄板銘柄の一つ Colgate-Palmolive Co. (CL)…

『米国人の死因、第3位は「医療ミス」か』の元論文をチェック

CNNが医療ミスが第3位の死因であり、推計25万人が毎年死亡している可能性がある。という論文がアメリカのジョンズ・ホプキンス大学の研究チームから発表されたとする記事を載せていますwww.cnn.co.jpこんなに多いには驚くべきことだ!という第一印象を…

高額医薬品ニボルマブ(オプジーボ)の価格はどう決められたのか

小野薬品工業が Medarex社(アメリカ)との共同研究により開発し、ブリストル・マイヤーズ社(アメリカ、Medarex社の親会社)と共同販売を行っている医薬品ニボルマブ(製品名 オプジーボ点滴静注20mg)は、悪性黒色腫(メラノーマ)、肺がんなどの各種がん…

制御棒が動かなくても原子炉は止められるという話

今度は「熊本地震により川内原発で制御棒の出し入れが100%作動できず、原発を停止できなくなっている」という話が広まっているようです。togetter.com大地震や大津波の直撃により、福島第一原発のようにありとあらゆる設備が破壊されたような状況であれ…

「原子炉を事前に停止すれば確かにリスクは下げられるという話」の感想戦

先日のブログ記事は、2日足らずで約3万という大量のアクセスを受けることができました。masa-cbl.hatenadiary.jp 私のような原子炉の素人が少し調べて書いた程度の記事がここまで話題になってしまうとは、完全に想定していませんでした。 (熱量を水量に変…

原子炉を事前に停止すれば確かにリスクは下げられるという話

熊本を中心とする九州地方での地震多発を受けて、川内原発を停止すべきとする意見が持ち上がっています。www.asahi.comこの件を受けたツイッターやブックマークコメントを見ると、「原発を止めても核燃料が入っている以上はリスクは変わらない」という内容の…

C言語の全角文字コメント行がコンパイルエラーを起こすことがある

エラーを引き起こすコメント行 とあるC言語のプログラムを Windows 上の Visual Studio 2008 で編集・作成し、完成したソースコードを Linux マシンにコピーし gcc でコンパイルしてデータ処理を実行という流れで作業を行っていました。その際に、ある全角…

「経済政策で人は死ぬか?」は政治家全員に読んでほしい本です

前々から気になっていた本を読み終えました。経済政策で人は死ぬか?: 公衆衛生学から見た不況対策作者: デヴィッドスタックラー,サンジェイバス,橘明美,臼井美子出版社/メーカー: 草思社発売日: 2014/10/15メディア: 単行本この商品を含むブログ (11件) を見…

Haswell Xeon E5 最上位CPU Xeon E5-2699 v3、E5-2697v3 を比較

Haswell世代のデュアルソケットCPUである Xeon E5-2600 v3 シリーズの最上位CPUである Xeon E5-2699 v3 と Xeon E5-2697 v3 を実際に使ってみる機会があったので、ベンチマークをとってみました。前世代である v2 世代の最上位である Xeon E5-2697 v2 も含め…

「消費税は安定税収」は国家財政(財務省)の甘え

安倍首相は消費税 8%→10% の増税を1年半延期することを決断し、平成26年11月21日(金)の衆議院本会議にて解散されました。 議事経過 第187回国会(平成26年11月21日) 消費税を予定通り引き上げるべきとする財務省に代表される勢力に対抗するため…

早稲田大学は裁判を覚悟の上ででも小保方さんの博士号を剥奪してほしい

本日早稲田大学より、小保方さんの博士号は取り消し規定に該当しないという結論が調査委員会により得られたという報告がありました。 理化学研究所の小保方晴子研究ユニットリーダーが2011年に早稲田大大学院で博士号を取得した論文について、早大の調査委員…

論文の査読ではデータ捏造などの不正を見つけることはあまり期待されていない

STAP細胞の件で同じ写真の使いまわしや、他の文献からのコピペ(剽窃)の疑惑が持ち上がっています。この点について査読で見つけられなかったのかという声がありますが、正直なところ査読ではこのような不正のチェックはさほど重視されていません。 実際にNa…

高校生の論文が載った雑誌はまともに査読をしていない疑惑のある論文誌のようです

高校2年生の生徒がインドの査読付き国際数学雑誌に論文が掲載されたというニュースがありました。 http://www.kaijo-academy.jp/press/2014/02/post_722.html高校生にして査読付き論文を発表できることは極めて異例ですので、この高校生は素晴らしい素質、能…

タイトルなりをコピペしてググれば直接論文のページに移動できたのね・・・

以前から文献中にでてきた論文を入手する場合、その雑誌のサイトに行って、過去のアーカイブ一覧に行って、該当する年(year)、巻数(volume)を探して・・・と辿っていました。例えばここのところ話題沸騰のSTAP細胞の論文であればObokata H. et al., Stim…

他大学での非常勤講師給与が20万を超えたら確定申告をしましょう

2か所以上から給与を受けており、年末調整を受けたメインの職場以外から給与が20万円以上の人は確定申告の義務があります。 No.1900 給与所得者で確定申告が必要な人|所得税|国税庁私は去年メインで働いている機関とは別の大学で複数の非常勤講師の授業を…

メールサーバの .imap.index が壊れたことに由来するメール送受信エラー対応

Linuxメールサーバの挙動がおかしかったため再起動をしたところ復旧したのですが、特定ユーザのみメール送受信がタイムアウトしてしまいうまくいかない現象が起きました。メールサーバは Postfix + Dovecot による構成です。 メールのログファイル /var/log/…

windows版VMD(32bit)の利用できるメモリ量を2GBから4GBに増やす

分子動力学計算結果の可視化などに用いられるプログラムVMD - Visual Molecular Dynamicsは Linux版、MacOS版、Windows版 が配布されています。なんだかんだでWindows版が一番使いやすいのですが、残念ながらWindows版は32bit版であり、64bit OSであっても利…

雪の重みで潰れたTSUTAYA花園インター店の屋根に積もった雪の重さを計算してみた

TSUTAYA花園インター店が雪の重みで潰れたことが話題になっています。【速報&悲報】 俺の地元のTSUTAYAがぁぁぁあああ!!!!! TSUTAYA花園インター店が雪の重みにより半壊!!! 火災警報やら色んな警報器が鳴り響いてる………… pic.twitter.com/kpB71GD5iF…

風力発電の採算を見積もってみた

原発事故以来、再生可能エネルギーの一種として風力発電所が注目されています。実際に太陽光発電と並んで固定価格買い取り制度(Feed-in Tariff, FIT)による買取対象となっています。今回は風力発電にどの程度の費用がかかり、どの程度の利益がでるものなの…

デンマークで若いキリンがなぜ殺処分されたのか

デンマーク、コペンハーゲンの動物園がキリンを殺処分し、解体の様子を公開、さらに死骸をライオンに食べさせるというニュースがありました。CNN.co.jp : 殺処分のキリン解体を一般公開、死骸はライオンの餌に デンマーク この動物園の行動に対して抗議がヒ…

sonyがVAIOから撤退かぁ

今日ソニーからPC事業(VAIO)から撤退するニュースリリースありました。 Sony Japan | ニュースリリース | PC事業の譲渡に関する意向確認書の締結についてVAIOのブランドは長野にあるPC事業拠点、従業員とともに日本産業パートナーズ株式会社に譲渡されま…

やっぱり授業中に個人の思想信条が絡む嘆願書を配るのはまずいよね

授業内における学生団体の要請活動への本学嘱託講師の対応について - HEADLINE NEWS - 立命館大学授業中に朝鮮学校無償化に関する嘆願書を配布したことが問題視され、大学から上リンクのような釈明文が出されました。いくつかのまとめブログが「単位を人質に…

Hadoopをコア数の多いマシンで使う場合はユーザプロセス数上限も増やす必要あり

先日導入した 24 CPUコア搭載マシン( Xeon E5-2697v2 搭載24コアマシンの性能と消費電力をチェック - 生物物理計算化学者の雛 )で Map スロット数 24 でHadoopジョブを流したところ、Map処理21本は正常に流れるが、残り3本はエラーで停止してブラックリス…

ポータブルBDプレーヤーBDP-Z1を購入

今日発売日のソニーのポータブルブルーレイディスクプレーヤーBDP-Z1を購入しました。 発売日は2013年12月21日となっていますが、ソニーストアでの先行予約販売で今日届きました。ソニー ポータブルブルーレイディスク/DVDプレーヤー BDP-Z1出版社/メーカー:…

iPhone4からiPhone5Sに移行

これまでiPhone4を使っていたのですが、先日iPhone5Sに機種変更をしてきました。 左がiPhone5S、右がiPhone4 縦長になり、より軽くなった iPhone5Sではディスプレイがより縦長になっており、アイコンがiPhone4では縦に4+1個表示されていたものが5+1個表示さ…

CentOSでGanglia可視化のためのhttpdサービスが起動不能になったことに対応

多数マシンの稼働状況を監視するプログラムGangliaでhttpdサービスによりブラウザ上での可視化を提供していたマシン(CentOS 5.5)にトラブルがあり再起動をしました。 Gangliaによる監視 ところが再起動してもGangliaの表示がされないため調べてみたところ…

理系のための人生設計ガイド 坪田一男著

ブルーバックスから発売されている「理系のための人生設計ガイド」を読みました。理系のための人生設計ガイド―経済的自立から教授選、会社設立まで (ブルーバックス)作者: 坪田一男出版社/メーカー: 講談社発売日: 2008/04/22メディア: 新書購入: 12人 クリ…

はてなダイアリーからはてなブログに引っ越しました

先月末(10/31)からなぜかGoogle Analyticsに集計されるアクセス履歴がモバイルからのアクセス(URLに /touch/ がつくもの)のみしか集計されなくなりました。調べてみても対応策がわからなかったので、これをきっかけに以前から考えていたはてなダイアリー…

Xeon E5-2697v2 搭載24コアマシンの性能と消費電力をチェック

先月記事にしたように(Ivy Bridge世代のXeon E5-2600 V2 の最上位CPUを比較)、2 CPU構成が可能なIvy Bridge世代のワークステーション向け新CPU Xeon E5-2600 v2シリーズが発売されています。先日、最上位の12コアCPU Xeon E5-2697 v2 を2CPU搭載したマシン…

ノーベル化学賞を共同受賞したWarshelとKarplusは複雑な人間関係?

昨日発表があった2013年のノーベル化学賞は、Martin Karplus, Michael Levitt, Arieh Warshel の3人がマルチスケールシミュレーションの業績で共同受賞しました。3人は分子動力学計算プログラムCHARMMの開発等で共同で研究していた時期があるため友好的な…

2013年ノーベル化学賞は多階層シミュレーション(QM/MM計算)の3人に

さきほど2013年ノーベル化学賞が発表され、 Martin Karplus, Michael Levitt, Arieh Warshel の3人が「for the development of multiscale models for complex chemical systems (複雑な化学系のマルチスケールモデルの開発に対して)」の仕事で受賞しました…

2013年ノーベル生理学・医学賞「小胞輸送」について3時間で勉強してまとめてみた

先ほど今年のノーベル生理学・医学賞が発表されました。http://www.nobelprize.org/nobel_prizes/medicine/laureates/2013/press.html受賞者は「小胞輸送」という現象の解明をしたアメリカの3教授(James E. Rothman, Randy W. Schekman and Thomas C. Sudh…

Ultrabook にピッタリなUSB3.0 から (ギガビット有線LAN+USB3.0×3) に接続するアダプタを購入

先日購入した Vaio Pro11 には有線LAN接続が無く(ACアダプタに接続するワイヤレスルータはありますが)、大量のデータをやりとりする時には有線LANのギガビットイーサネットによる高速データ転送を行いたくなります。そのためギガビット有線LANを接続可能な…

博士課程に進む人が(主に経済的な面で)覚悟しておくべきこと

データ分析業界の博士人材がアカデミア(学術界)から民間のコンサルタント等に転身しているひとが多いという記事がありました。ここ最近の博士人材の動向を見ながら感じていること -銀座で働くデータサイエンティストのブログ-大学の助教・講師・准教授・教…

海外出張の時はスーツケースに目印をつけて写真を撮っておこう

この記事を読んで以前出張時に空港でスーツケースが出てこなかったトラブルに遭ったときのことを思い出しました。英語が、だめだ・・ - 女性教授奮闘記 from Toyama -日本を出発してマレーシア・クアラルンプールの空港に到着したのですが、自分のスーツケー…

Ivy Bridge世代のXeon E5-2600 V2 の最上位CPUを比較

デュアルCPU構成の標準的なサーバ・ワークステーションで使われるXeon E5シリーズの新世代CPU Xeon E5-2600 v2 シリーズが発売されました。怒涛の12コア24スレッド“Ivy Bridge-EP”Xeon E5-2600 v2降臨 (CPUリスト表あり)CPU性能の高いマシンを調達するぞー…

消費税増税は日本の景気を永続的に悪化させるからやめたほうがいいんじゃないかなぁ

私にとってものすごく腑に落ちる消費税増税のマイナス面の解説記事を見つけました。 簡単に言えば(下に要旨もありますが)消費税増税の影響は、住宅や自動車などの特に高額の耐久消費財に選択的、集中的に現れると考えられます。※所得が伸びない中、増税で…

検査をすると見つかる甲状腺がんって結構多い(超音波検査で0.5%の発見率)

昨日(2013/8/20)福島県の甲状腺がんのスクリーニング検査で約19万3千人に対して18人が甲状腺がん、25人が甲状腺がんの疑い、1人が良性だと診断されたニュースがありました。 福島の子どもの甲状腺がん、疑い含め44人に 16人増疑い例を含めれば 44/193,…

今後の日本国内での資金の流れを予想してみる

先日、日本の借金額が1,000兆円を突破したことがニュースになりました。 初の1000兆円突破=「国の借金」膨張止まらず―1人当たり792万円・6月末私はこの国の借金増加自体はさほど大きな問題ではないと認識しています。 参考:政府の負債という「幽霊」を恐れ…

「1歳未満の乳児は週一晩母親と離れると精神が不安定になる」の原論文をチェック

今日こんな記事を見つけました。生後12ヶ月未満の乳児は、週に一晩でも母親と離れて暮らすと精神が不安定になる:米調査結果 生後12ヶ月未満の赤ちゃんで1週間に一晩かそれ以上母親と離れて暮らしている子は、精神が不安定で、母親との結束が弱いことが明ら…

ブログ2周年を機に過去を振り返る(後半)

少し間が空きましたが、前回記事(ブログ2周年を機に過去を振り返る(前半))の続きとして今年に入ってからを振り返ります。 純粋な科学ネタでホットエントリ入りし、週間 5,000 PV を達成 年明けに絶対零度より低温の気体を実証というネタがホットエント…

ブログ2周年を機に過去を振り返る(前半)

私がこのブログを書き始めて2年間が経ったので、記念にこのブログの過去を振り返っておきます。 ブログ1年目 2011年7月2日〜2012年7月1日 ほとんど放置 このブログを開始したのは2011年7月2日で、書き始めたきっかけは Hadoop ネタをブログに書いておくと…

VAIO Pro ワイヤレスルータ VGP-WAR100 で固定IPアドレスのLANに接続する

VAIO Pro 11/13 には有線LAN端子が無いですが、アクセサリであるワイヤレスルータ VGP-WAR100 経由でインターネット接続を行うことができます。ソニー VAIO Pro13/11/Duo13専用 ワイヤレスルーター VGP-WAR100出版社/メーカー: ソニー発売日: 2013/06/22メデ…

VAIO Pro 11 到着!スピーカとSSD残り容量をチェック&感想

今日の朝、ソニーストアに注文していたVAIO Pro 11 がヤマト宅急便で到着しました。 箱を受け取った時の軽さにはちょっと感動してしまいました。 外箱の中にVAIO Pro 11 が入った黒い箱と、アクセサリ2つ(ワイヤレスルーター、HDMI-VGA変換ケーブル)が入…

VAIO Pro 11 の消費電力を実測し、バッテリー駆動時間を見積もった

前回記事(VAIO Pro 11 到着!スピーカとSSD残り容量をチェック&感想)に続き、今回はVAIO Pro 11 の消費電力を測定を行いました。(6/30 バッテリー駆動時間実測結果を追加)消費電力の測定にはワットチェッカーを利用し、サンワサプライ ワットチェッカー…

Adobe Creative Cloud アカデミック版 月3,000円に値下げの連絡

昨日 Adobe から「Creative Cloudに関する重要なお知らせ」というメールが届きました。Creative Cloud アカデミック版の料金が月4,000円から月3,000円に値下げされ、次の支払から反映されるという連絡でした。 学生・教職員個人版の新価格ならびに新バージョ…

少なくとも自分の専門分野ではケタがおかしな数字に気付けるようになろう

こんな記事が上がっていました。今日生産される研究論文の膨大な量は個人が正しく選別すること不可能, そこでSciencescapeがお助けに内容としては近年膨大な数の論文が発表されるようになりまともに全部チェックすることは不可能になりつつあるので、多数の…

Windows 8のウルトラブックで使えるドッキングステーションを調べてみた

以前記事にしたように(VAIO Pro 11 を注文―VAIO Pro 13, Duo 13との比較結果―)今週末(2013/6/23(日))に VAIO Pro 11 が届く予定です。出先から家や職場に戻る度に、USBマウス・キーボードを繋いで、有線LANを繋いで(VAIO Pro 11には有線LANの口はありま…

太陽系の惑星運動シミュレーションと分子動力学計算のスケールを比較

ふとしたきっかけで、地球と火星が数十億年後に衝突する可能性があるよー、というシミュレーション研究が数年前に話題になっていたことを思い出し、元記事を見つけました。35億年後、地球が火星と衝突する?パリ天文台が試算論文で主張している結果について…

論文―遺伝子組み換え穀物で育ったブタ、深刻な胃炎リスク増大―の統計学的検定を検算してみた

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遺伝子組み換え穀物のみを飼料として与えたブタは、通常の穀物飼料で育てた場合よりも胃炎を発症する確率が大幅に高いことを示した論文が発表されました。実験条件等についてはこちらの記事を参考にしてください。 遺伝子組み換え穀物で育ったブタ、胃炎リス…